當色譜柱使用較長時間之后，就可能發生柱壓升、分離度不好、柱效降低、峰形不好等情況，這時就需要根據故障原因對色譜柱進行清堵與再生，以延長色譜柱的使用壽命。具體原因及處理方法如下：

    （1）篩板堵塞與柱頭塌陷：主要現象有柱壓嚴重升或不穩定、色譜峰拖尾、色譜峰變寬、色譜峰分叉、禿峰等，需要進行清堵與彈性復原處理。（此方法適合于任何類型有相同故障的色譜柱的處理，不同的是溶劑要與相應類型色譜柱匹配。）

    主要處理方法如下：

    ①一般情況下，將色譜柱反接，不接檢測器，用純水或水-有機相（多用甲醇、乙腈）（95:5）以0.6ml/min流速沖洗約4h→再正向連接，接或不接檢測器，用純水或水-有機相（多用甲醇、乙腈）（95:5）以0.6ml/min流速沖洗約1h→再提流速至1.0ml/min沖洗1h，觀察柱壓變化。若不湊效，則擰開柱頭螺母（色譜柱進口），小心取下篩板，用5%左右的硝酸溶液聲處理20min左右，再用純水聲20min左右。用小勺清理掉柱進口污染的部分填料，再將用乙醇調和后的相應的硅膠裝入柱入口（也可用已經報廢的同類柱中的填料替代），用平面不銹鋼小鏟壓緊填平至略出柱管口，但量不宜太多，否則，壓得太緊柱壓會升，然后裝上清洗過的篩板，注意篩板安裝方向必需與原裝相同，后緊固。

    ②沖洗與飽和：清堵緊固后，反向連接色譜柱，不接檢測器，用純水或水-有機相（多用甲醇、乙腈）（95:5）以0.3ml/min流速沖洗約4h→再換成甲醇以0.5ml/min流速沖洗約2h →再正向連接色譜柱，接或不接檢測器，用純水或水-有機相（多用甲醇、乙腈）（95:5）以0.3ml/min流速沖洗約2h→再換成甲醇以0.5ml/min流速沖洗約1h→然后用甲醇或乙腈以1ml/min流速沖洗約1h以上，再根據測試用流動相比例調整水-甲醇（或乙腈）比例，以1ml/min流速沖洗約1h，后用測試用流動相平衡2h，進樣測試即可。

    ③說明：如不是情況，按其他辦法可行，則好不要反沖色譜柱和拆卸篩板。（2）柱效降低：主要特征性現象有柱壓基本正常，但出現拖尾峰、禿峰、分叉峰、前延峰、峰變寬、基線漂移、理論板數降低、分離度降低等。需要進行再生處理，

    具體方法如下：

    ①一般情況下，順接色譜柱，按如下溶劑順序及條件沖洗：95%水-5%甲醇（或乙腈）（1.0ml/min，1h以上）→100％甲醇（1.0ml/min，1h以上）→100％乙晴（1.0ml/min，1h 以上）→75％乙晴-25％異丙醇（0.5ml/min，10倍柱體積以上）→100％異丙醇（0.5ml/min，10倍柱體積以上）→100％二氯甲烷（0.5ml/min，10倍柱體積以上）→100％正己烷（0.5ml/min，10倍柱體積以上，根據實際情況可忽略）→100%異丙醇（0.5ml/min，20倍柱體積以上）→95%水-5%甲醇（或乙腈）（0.5ml/min，30min；再升至1.0ml/min，10倍柱體積以上）→檢測用流動相平衡2h或至基線平穩，進樣測試。在沖洗過程中，隨時關注柱壓變化，確保不過4000psi；若出，可通過降低流速，升柱溫來調整，具體操作可咨詢具備相關知識背景和實踐經驗的人士。

    ②若上述方法效果不理想，可按如上溶劑順序和條件，反接色譜柱沖洗→再順接色譜柱，用100%乙腈以1ml/min流速沖洗約2h→再用與流動相同比例的水-有機相以1ml/min流速沖洗約30min→后用流動相平衡2h或至基線平穩，進樣測試即可。

    ③說明：再生過程必須隨時關注柱壓變化，柱壓過易導致硅膠變形與開裂及鍵合相性端連接順序紊亂，同時要再生時間足夠。